สำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ได้เปิดสำนักงานขึ้นเป็นครั้งแรกในราวปี พ.ศ.2477 สังกัดกรมสหกรณ์ กระทรวงพาณิชย์ โดยได้เช่าบ้านพักของเอกชน ซึ่งตั้งอยู่ริมแม่น้ำป่าสักใช้เป็นสำนักงานชั่วคราว สหกรณ์จังหวัด คนแรก คือ นายกมล ชลศึก ต่อมาได้ย้ายไปรวมอยู่กับศาลากลางจังหวัดซึ่งในขณะนั้นตั้งอยู่ ณ พระที่นั่งพิมานรัตนา ภายในวังจันทร์เกษม ในปี พ.ศ.2484 เมื่อทางราชการได้ปลูกสร้างตึกศาลากลางจังหวัดขึ้นเสร็จเรียบร้อยแล้ว จึงได้ย้ายสำนักงานไปอยู่ ณ ศาลากลางจังหวัด ต่อมาปรากฎว่าบรรดาสมาชิกไม่สะดวกในการติดต่อกับพนักงานสหกรณ์ ในปี 2492 จึงได้ย้ายสำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยาจากตึกศาลากลางจังหวัดไปอยู่ ณ อาคารของกระทรวงการคลังภายในวังจันทร์เกษม ในปี พ.ศ.2519 กรมส่งเสริมสหกรณ์ สังกัดกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ได้จัดสรรงบประมาณให้สำนักงานสหกรณ์จังหวัด 250,000 บาท เพื่อก่อสร้างสำนักงานอาคาร 2 ชั้น บนที่ดินของราชพัสดุแปลงหมายเลข 21276 กว้าง 40 เมตร ยาว 180 เมตร เนื้อที่ 4 ไร่ 2 งาน ก่อสร้างแล้วเสร็จเมื่อวันที่ 19 สิงหาคม 2520 ซึ่งใช้เป็นสำนักงานสหกรณ์จังหวัดในปัจจุบัน ตั้งอยู่เลขที่ ข 5/22 ถนนปรีดีพนมยงค์ ตำบลหอรัตนไชย อำเภอพระนครศรีอยุธยา จังหวัดพระนครศรีอยุธยา 13000 ในปี พ.ศ.2546 กรมส่งเสริมสหกรณ์ได้จัดสรรงบประมาณให้สำนักงานสหกรณ์จังหวัด 590,000 บาท เพื่อต่อเติมอาคารด้านหน้าชั้นเดียว เพื่อให้เพียงพอกับจำนวนข้าราชการทั้งหมด ในปี พ.ศ.2554 จังหวัดพระนครศรีอยุธยาได้ประสบเหตุมหาอุทกภัยน้ำท่วมครั้งยิ่งใหญ่ สำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ได้รับความเสียหายทั้งอาคารและทรัพย์สิน ระดับน้ำสูงประมาณ 2 เมตร ในปี พ.ศ.2555 กรมส่งเสริมสหกรณ์ได้จัดสรรงบประมาณก่อสร้างอาคารสำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยาหลังใหม่ 3 ชั้น จำนวนเงิน 8,380,865 บาท ณ ที่ราชพัสดุแห่งนี้ และได้ทำการก่อสร้างแล้วเสร็จ เมื่อวันที่ 15 ตุลาคม 2557 ซึ่งอาคารหลังนี้สามารถรองรับการปฏิบัติหน้าที่ อำนวยความสะดวกให้บริการแก่สหกรณ์ กลุ่มเกษตรกร กลุ่มอาชีพของสถาบันเกษตรกร และประชาชนทั่วไปที่มารับบริการเป็นอย่างดี ทั้งยังเป็นศูนย์เรียนรู้ด้านการสหกรณ์ ปัจจุบันสำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ดูแล แนะนำ ส่งเสริม สหกรณ์ กลุ่มเกษตรกร จำนวน 138 แห่ง สมาชิกจำนวน 75,717 ครอบครัว สำนักงานฯ มีบุคลากรทั้งสิ้น จำนวน 57 คน สำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยาได้ทำกำหนดพิธีเปิดอาคารสำนักงานหลังใหม่ 3 ชั้น อย่างเป็นทางการ เมื่อวันที่ 27 เมษายน พ.ศ.2558 ปัจจุบันสำนักงานสหกรณ์จังหวัดพระนครศรีอยุธยา ตั้งอยู่เลขที่ 5/22 ถนนปรีดีพนมยงค์ ตำบลหอรัตนไชย อำเภอพระนครศรีอยุธยา จังหวัดพระนครศรีอยุธยา สหกรณ์จังหวัดคนปัจจุบัน คือ นายสรรเสริญ พนิชการ (คนที่ 30)